蛋白复合体鉴定
蛋白质很少单发挥作用,在所有生物功能中,蛋白复合体的功能占主导地位。在所有细胞中,蛋白质是重要的组成部分,并且在大多数细胞功能中蛋白质间的相互作用是基本的活动
SWATH定量方法确定蛋白复合体的成分是SWATH定量方法常用的应用之一。
金开瑞借助质谱平台,开发了一套从实验到生物信息分析的AP-SWATH流程,采用TAP技术将目标靶蛋白的相互作用蛋白特异性富集,然后结合具有高灵敏度、高准确度、高通量等特点的SWATH定量技术,能够高特异性的准确富集到靶蛋白的特异性相互作用蛋白,实现蛋白复合体的准确鉴定。
一、服务特色
技术特点
1、金开瑞是国内首推SWATH定量蛋白质组技术服务的公司;
2、采用AP-SWATH技术,不需要过多的背景知识就可以得到大量含靶蛋白的复合体;
3、蛋白表达及与复合物的结合都接近生理水平;
4、采用两步亲和纯化,大大提高了纯化产物的特异性。
适用范围
TAP更倾向于高丰度和稳定的相互作用,许多低亲和力、瞬时和依赖特殊细胞环境的相互作用可能检测不到
特别适用于研究蛋白质在生理条件下的相互作用
一次实验只能检测一个蛋白的相互作用蛋白
二、服务说明
服务流程
接受订单及样品—亲和纯化产物—LC-MS/MS—数据解析—蛋白复合体确认—结果交付
客户提供
需鉴定的样品(胶粒/条带、液体、干粉);
样品要求:1、样品含量:50-1000Fmol (根据检测项目而定)
2、胶类样品:银染过程中未使用戊二醛作为固定剂
3、保存方式:液体建议低温,胶类用去离子水防干
4、非胶样品要求:挥发性盐<20mM,无PBS、SDS和尿素等物质
样品信息单;需详细填写样品来源、含量、状态及其他基本信息
终交付
实验报告一份,含具体实验流程及蛋白复合体鉴定结果(生物信息学分析)。
生物信息学分析内容包括:
1、根据参考谱图库解析SWATH谱图,鉴定肽段、蛋白,结果可靠性评估;
2、根据碎片离子的XICs进行相对定量,差异表达分析;
3、对鉴定到蛋白GO功能注释、Pathway代谢通路注释;
4、差异表达蛋白GO、Pathway功能富集分析;
5、主成分分析(PCA),发现差异蛋白质或者复合体成员。
三、服务周期及报价
服务周期
自送样起30个工作日。
服务报价
请询价。
金开瑞生物拥有分子生物学、蛋白质组学、蛋白表达、抗体制备、综合项目、检测分析等六大服务平台,为生物技术领域的科研人员提供的技术服务。
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